Sıkça Sorulan Sorular
Aşağıda müşterilerimizden sıklıkla duyduğumuz sorulara cevaplarımızı bulabilirsiniz. Diğer sorularınız için bizimle info@goldgen.com.tr adresinden irtibata geçebilirsiniz.
Nasıl sipariş verebilirim?
Primer sipariş formumuzu anasayfamızda bulunan linkten indirerek doldurup info@goldgen.com.tr adresine göndererek siparişinizi verebilirsiniz. Mailiniz bize ulaştıktan sonra tarafınıza sipariş onayı ve teslimat tarihini içeren bir e-mail gönderilecektir. Alternatif olarak online sipariş sistemini de kullanabilirsiniz.
Sipariş verdiğim primerler ne zaman teslim edilir?
Standart saflaştırma ve OPC yapılan primerleriniz sentezin ertesi günü teslime hazır olmaktadır. HPLC saflaştırma yapılan primerleriniz / modifiye primer ve probe’larınız için lütfen bizimle iletişime geçiniz. Rutin sentez günlerimiz aşağıda verilmiştir.
Sentez Takvimi
| 40 baz ve altı olan primlerin takvim tablosu | |||
| PAZARTESİ | SALI | ÇARŞAMBA | PERŞEMBE |
| 10:00 50nmol |
10:00 50nmol |
||
| 16:00 100nmol |
16:00 50nmol-uzun |
16:00 100nmol |
16:00 200nmol |
- Rutin sentez günlerimiz her haftanın Pazartesi, Salı, Çarşamba ve Perşembe günleridir.
- 100 nmol sentez günlerimiz her haftanın Pazartesi ve Çarşamba günleri saat 16.00’da başlamaktadır..
- 50 nmol sentezimiz Pazartesi ve Çarşamba günü 10.00’da başlamaktadır.
- Pazartesi ve Çarşamba sentez saatinden önce verilen 50 nmol ve 100 nmol skaladaki standart saflaştırılmış 50 baz altı uzunluktaki oligo siparişleri ertesi gün saat 16:00 da hazırlanmış olur.
- 200 nmol sentezimiz Perşembe günü saat 16.00’da başlamaktadır
- 50 baz ve üzeri oligolar (50 nmol) Salı günü saat 16.00’da senteze alınır.
- 40 baz üzeri primerler için HPLC yada OPC saflaştırma önerilmektedir. Aksi halde garanti kapsam dışı kalır.
- Siparişleriniz sipariş sırasına göre üretime alınır. O günkü sentezin hacmi doldu ise siparişiniz bir sonraki senteze kaydırılır.
- 40 adet oligo ve üzeri siparişler toplu sipariş olarak değerlendirilir. Teslimat süresi için lütfen bize ulaşınız.
Hangi saflaştırma türünü seçmeliyim?
Saflaştırma olarak standart saflaştırma, OPC (RP-HPLC grade), ve HPLC seçenekleri mevcuttur.
Standart saflaştırma olarak desalting işlemi gerçekleştirilir ve primerler istenmeyen tuzlardan arındırılır. 35 baz ve daha kısa oligolar için, PCR uygulamalarında kullanılacak oligolar da dahil olmak üzere birçok uygulama için bu yöntem kullanılabilir.
OPC yöntemi ile hatalı sekanslar, yan ürünler, kirlilikler elenir. Bu yöntem ile elde edilen primerler sekans, PCR, hibridizasyon probe’ları için ve gen sentezi için kullanılabilir. 60 Baz uzunluğundaki nükleotidlere kadar OPC purifikasyonu tavsiye edilir.
HPLC yöntemi tüm n-1 oligo yan ürünlerinden kurtulmak için en etkili yöntemdir. Klonlama çalışmaları gibi tek bazlık hataların tolere edilmeyeceği çalışmalar için tercih edilebilir. Ayrıca modifiye oligonükleotidler için de tavsiye edilen saflaştırma yöntemidir. 50 nmol sentezinde HPLC saflaştırma seçeneğinde miktar garantisi bulunmamaktadır.
Hangi skalada sipariş vereceğimi nasıl belirleyebilirim?
Aşağıdaki tablo 100 µL PCR reaksiyonunda son primer konsantrasyonu olarak 0.1-0.5 µM kullanıldığı kabul edilerek hazırlanmıştır :
| Sentez Skalası | Tahmini PCR reaksiyon sayısı |
| 25 nmol | 500-2500 |
| 50 nmol | 1000-5000 |
| 200 nmol | 4000-20000 |
Tercih ettiğim sentez skalası bana teslim edilen ürün miktarı ile aynı mı olmalıdır?
Tercih edilen skala senteze başlama miktarını belirlemektedir. Saflaştırma türüne göre teslim edilecek ürün miktarı değişkenlik göstermektedir. Farklı skala ve saflaştırma türlerinde teslim edilebilecek en düşük ürün miktarı aşağıdaki tabloda verilmiştir:
| Garanti OD miktarları | ||||
| Skala | 50 nmol | 100 nmol | 200 nmol | 200 nmol + HPLC |
| Garanti – min OD | 2 OD | 6 OD | 12 OD | 6 OD |
Primer/probe dizaynı yapıyor musunuz?
Primer/probe dizaynı hizmetimiz bulunmaktadır. Dizaynı bizim tarafımızdan yapılan primer/probe’lar optimizasyonu yapılıp optimizasyon raporu ile birlikte çalışır halde teslim edilmektedir. Bunun için bu hizmeti paket halinde aşağıdaki kalemleri kapsayacak şekilde vermekteyiz :
-Primer/probe dizaynı
-PZR optimizasyonu
-Pozitif kontrol (gen fragmenti) sentezi
Modifiye primer üretimi yapıyor musunuz?
Aşağıdaki tabloda yer alan modifikasyonlara sahip oligonükleotidlerin üretimini rutin olarak yapmaktayız. Eğer istediğiniz modifikasyon bu tabloda yer almıyorsa lütfen bizimle iletişime geçiniz.
|
5’ modifikasyon |
|
FAM |
|
HEX |
|
JOE |
|
Biotin |
|
Phosphate |
|
Amino |
|
Thiol |
Prob üretimi yapıyor musunuz ?
Aşağıdaki tabloda yer alan boya ve quencher’ları içeren Taqman probe’larının üretimini yapmaktayız. Eğer istediğiniz probe’a ait boya/quencher bu tabloda yer almıyorsa lütfen bizimle iletişime geçiniz.
| 5’ | 3’ |
| FAM | TAMRA |
| FAM | BHQ-1 |
| HEX | BHQ-1 |
Modifiye primer/prob siparişim için boya/quencher’ları nasıl seçmeliyim?
Modifiye primer/problarınızda kullanılacak boyaların excitation ve emission dalga boyları kullanılacak cihazın lazer ve filtreleri ile uyumlu olmalıdır. Cihazınıza ait lazer ve filtre bilgilerine cihazınızın web sitesi/kullanım kılavuzundan ulaşabilirsiniz. Modifiye primer/probe üretiminde kullanmakta olduğumuz boyalara ait excitation/emission dalga boyları aşağıdaki tabloda verilmiştir:
| Boya | Excitation (nm) | Emission (nm) |
| FAM | 494 | 518 |
| HEX | 535 | 556 |
| JOE | 520 | 548 |
Taqman probe’ları için önerilen boya/quencher çiftleri aşağıdaki tabloda verilmiştir :
| 5’ | 3’ |
| FAM | TAMRA |
| FAM | BHQ-1 |
| HEX | BHQ-1 |
Tüplerin içinde ürün görünmüyor. Sebebi ne olabilir?
Sentezlenen tüm oligonükleotidler kurutulmuş (liyofilize) halde teslim edilmektedir. Ürünlerin renksiz olması nedeniyle kurutulmuş halde tüpte farkedilmeleri, özellikle düşük skalada, oldukça zordur.
Tüplerin dibinde jelimsi, hafif kahverengi bir ürün var. Normal midir?
100 nmol ve 200 nmol sentezlerde ürün yoğunluğundan dolayı kurutma sonrası bu görüntü normaldir. Primerinizi standart şekilde sulandırıp çalışabilirsiniz.
Oligonükleotidlerim elime ulaştı, hangi koşullarda saklamalıyım?
Liyofilize olarak teslim edilen primerler oda sıcaklığında saklanabilir. Sulandırılan primerlerin saklama sıcaklığı -20 ºC dir. Primerlerinizi uzun süreli saklamak için TE Buffer ile çözünüz ve stok primerlerinizi don-çöz yapmayınız, kullanacağınız kadar seyreltip bölünmüş porsiyonlar (aliquot) halinde muhafaza ediniz.
| Saklama Koşulları | Sıcaklık | Maksimum Depolama Süresi |
| Liyofilize | -200C | < 1 yıl |
| Liyofilize | Oda sıcaklığı | 1 ay’a kadar |
| Solüsyon içerisinde | -200C | < 6 ay |
| Solüsyon içerisinde | Oda sıcaklığı | 1 hafta’ya kadar |
Oligonükleotidlerimi nasıl sulandırmalıyım?
100 µM ana stok için eklenmesi gereken çözücü miktarı kullanım kılavuzunda (datasheet) yer almaktadır. Oligonükleotidleri çözmek için TE (Tris-EDTA tampon çözeltisi) veya DNaz/RNaz içermeyen su (DNase/RNase free water/DEPC water) kullanılabilir.
Primerlerin çalışma konsantrasyonu ne olmalıdır?
Kullanılacak primer konsantrasyonu çalışılacak yönteme bağlı olarak değişkenlik gösterebilir. Rutin PZR uygulamaları için 10 µM ara stok oluşturup 25 µL PZR reaksiyonu için bu ara stoktan 0.5 µL kullanılabilir.
Primerler için garanti süreci nasıl işlemektedir?
Primerleriniz kullanım kılavuzuna uygun bir şekilde sulandırıldı, saklandı ancak çalışmıyor ise aşağıdaki koşulları sağlaması durumunda garanti kapsamında ücretsiz olarak tekrar sentezlenecektir. Garanti süremiz üretim sonrası 6 aydır.
-Oligonükleotid dizisinin bir yayından alınmış olması (ilgili yayını lütfen e-mail ile bize iletiniz) ya da,
-Daha önce laboratuvarınızda rutin olarak kullanılmakta olan bir dizi olması.
